废水中相当一部分溶解性有机污染物是无法被物化法去除的，必须采用生化处理工艺来降解。目前采用的生化处理工艺是以活性污泥法生物处理技术为主体，该方法处理工艺成熟，对废水中有机污染物去除率高。以城市废水处理厂活性污泥为菌种，其活性污泥SV30为15～20%，投入活性污泥曝气池中进行污泥接种。曝气池中先灌满经物化处理后的废水，控制曝气池中废水CODcr浓度在500mg/L左右进行闷曝。闷曝3～5天后开始小水量连续进水，每天检测曝气池出水的CODcr浓度和污泥SV30。曝气池混合液经沉淀后，上清液排到集水井中，污泥不外排，这样，经过一段时间的培养和驯化后，污泥的活性增强，凝聚、沉降性能良好，曝气池混合液经30分钟沉淀后，污泥沉降比有30%左右，上清液清澈透明，这表明活性污泥已经培养成熟，即可投入正常运转。
物化处理单元采用气浮工艺，通过投加絮凝剂(PAC)和助凝剂(PAM)使废水中动植物油等有机污染物形成絮体，并使废水中产生大量的微细气泡，促其粘附于杂质絮体颗粒上，形成比重小于水的浮体上浮水面，从而去除相当一部分动植物油等有机污染物，降低后续生化处理的负荷。气浮PAC投加量为300PPM，PAM投加量为10PPM，此段CODcr的平均去除率为50%，SS的平均去除率为80%，动植物油的平均去除率为80%。
对食品厂废水处理通常采用厌氧法、好氧法、厌氧-好氧法等多种处理方法，这些方法对CODcr、BOD5均有不同程度的削减，但对动植物油的处理效果不好。针对该企业生产废水中动植物油含量高的实际情况，通过采用隔油-高效气浮的预处理措施，将废水中大部分动植物油去除后再进行好氧生化处理。通过调试和试运行，废水处理系统运行稳定，废水经处理后达到了排放标准的要求。
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